Công ty S99 đã được Tổng Công ty Sông Đà giao tham gia thực
hiện nhiều nhiệm vụ quan trọng trên những công trình trọng điểm của đất nước
như : Nhà máy thủy điện Sơn La, Nậm Pàn, Sê San, Tuyên Quang, Mường Pồn, Đường
Hồ Chí Minh đoạn qua Thừa Thiên Huế, Đường cao tốc Nội Bài - Vĩnh Yên, Tuyến
cáp sợi quang đường Hồ Chí Minh ... và nhiều công trình khác .